Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cfap53Q9D439 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cfap53Q9D439 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cfap53Q9D439 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms