Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Rsph14Q9D3W1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rsph14Q9D3W1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms