Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Snx29Q9D3S3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx29Q9D3S3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx29Q9D3S3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms