Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rufy3Q9D394 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rufy3Q9D394 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rufy3Q9D394 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms