Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Snrnp35Q9D384 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Snrnp35Q9D384 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snrnp35Q9D384 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms