Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
4930583I09RikQ9D2E3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms