Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc6bQ9D289 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Trappc6bQ9D289 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms