Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl53Q9D1H8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl53Q9D1H8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms