Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lmbr1lQ9D1E5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lmbr1lQ9D1E5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms