Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cysrt1Q9D1E4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cysrt1Q9D1E4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cysrt1Q9D1E4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cysrt1Q9D1E4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cysrt1Q9D1E4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cysrt1Q9D1E4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms