Protein–RNA interactions for Protein: Q9D162

Ccdc167, Coiled-coil domain-containing protein 167, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc167Q9D162 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ccdc167Q9D162 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc167Q9D162 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms