Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0E3

Lysmd1, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd1Q9D0E3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lysmd1Q9D0E3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lysmd1Q9D0E3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lysmd1Q9D0E3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms