Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
2610524H06RikQ9CZU9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
2610524H06RikQ9CZU9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms