Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Thumpd2Q9CZB3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Thumpd2Q9CZB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms