Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ssbp2Q9CYZ8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ssbp2Q9CYZ8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms