Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prelid3bQ9CYY7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prelid3bQ9CYY7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms