Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem175Q9CXY1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem175Q9CXY1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem175Q9CXY1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms