Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW6

3100002H09Rik, RIKEN cDNA 3100002H09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3100002H09RikQ9CXW6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
3100002H09RikQ9CXW6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
3100002H09RikQ9CXW6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
3100002H09RikQ9CXW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms