Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sgo1Q9CXH7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sgo1Q9CXH7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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