Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Tmed5Q9CXE7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Tmed5Q9CXE7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Tmed5Q9CXE7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms