Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
RpainQ9CWY9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RpainQ9CWY9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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