Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tdrd12Q9CWU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tdrd12Q9CWU0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tdrd12Q9CWU0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms