Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Smyd3Q9CWR2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smyd3Q9CWR2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smyd3Q9CWR2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.2 ms