Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
BccipQ9CWI3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BccipQ9CWI3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms