Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Smurf1Q9CUN6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smurf1Q9CUN6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms