Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Otud1Q9CUB6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Otud1Q9CUB6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Otud1Q9CUB6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Otud1Q9CUB6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Otud1Q9CUB6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms