Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Six6os1Q9CTN5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Six6os1Q9CTN5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms