Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rprd1bQ9CSU0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rprd1bQ9CSU0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms