Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Snw1Q9CSN1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Snw1Q9CSN1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snw1Q9CSN1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms