Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gnpda2Q9CRC9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Gnpda2Q9CRC9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gnpda2Q9CRC9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms