Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atg12Q9CQY1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atg12Q9CQY1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms