Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW9

Ifitm3, Interferon-induced transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm3Q9CQW9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ifitm3Q9CQW9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ifitm3Q9CQW9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ifitm3Q9CQW9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms