Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim8Q9CQQ0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Smim8Q9CQQ0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smim8Q9CQQ0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms