Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rdm1Q9CQK3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rdm1Q9CQK3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rdm1Q9CQK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms