Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed6Q9CQG0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tmed6Q9CQG0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms