Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nudt21Q9CQF3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Nudt21Q9CQF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudt21Q9CQF3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudt21Q9CQF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudt21Q9CQF3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudt21Q9CQF3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudt21Q9CQF3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudt21Q9CQF3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Nudt21Q9CQF3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
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