Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab5aQ9CQD1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rab5aQ9CQD1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rab5aQ9CQD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms