Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rpl39lQ9CQD0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Rpl39lQ9CQD0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rpl39lQ9CQD0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl39lQ9CQD0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Rpl39lQ9CQD0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rpl39lQ9CQD0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Rpl39lQ9CQD0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Rpl39lQ9CQD0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Rpl39lQ9CQD0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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