Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sar1bQ9CQC9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sar1bQ9CQC9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms