Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ubl4bQ9CQ84 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ubl4bQ9CQ84 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ubl4bQ9CQ84 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Ubl4bQ9CQ84 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms