Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ45

Nenf, Neudesin, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NenfQ9CQ45 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NenfQ9CQ45 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NenfQ9CQ45 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NenfQ9CQ45 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms