Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Chmp3Q9CQ10 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp3Q9CQ10 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp3Q9CQ10 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms