Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cntnap2Q9CPW0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cntnap2Q9CPW0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cntnap2Q9CPW0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms