Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt88Q9CPR6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krt88Q9CPR6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms