Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPP0

Npm3, Nucleoplasmin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm3Q9CPP0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Npm3Q9CPP0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Npm3Q9CPP0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Npm3Q9CPP0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms