Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Bcl11bQ99PV8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Bcl11bQ99PV8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Bcl11bQ99PV8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms