Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ino80bQ99PT3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ino80bQ99PT3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ino80bQ99PT3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms