Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt23Q99PS0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt23Q99PS0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt23Q99PS0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt23Q99PS0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt23Q99PS0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt23Q99PS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Krt23Q99PS0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Krt23Q99PS0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Krt23Q99PS0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms