Protein–RNA interactions for Protein: Q99PI4

Lpin3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpin3Q99PI4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lpin3Q99PI4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lpin3Q99PI4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lpin3Q99PI4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lpin3Q99PI4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lpin3Q99PI4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lpin3Q99PI4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lpin3Q99PI4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lpin3Q99PI4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms