Protein–RNA interactions for Protein: Q99PH1

Lrrc4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc4Q99PH1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Lrrc4Q99PH1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lrrc4Q99PH1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms